Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG4Q9H9E3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms