Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A7

RMI1, RecQ-mediated genome instability protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI1Q9H9A7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RMI1Q9H9A7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RMI1Q9H9A7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMI1Q9H9A7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms