Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf42Q9H799 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C5orf42Q9H799 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms