Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAS3Q9H6U6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAS3Q9H6U6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms