Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF3Q9H4W6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF3Q9H4W6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms