Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SENP3Q9H4L4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SENP3Q9H4L4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms