Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB1Q9H4B7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB1Q9H4B7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms