Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3L0

MMADHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D protein, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMADHCQ9H3L0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMADHCQ9H3L0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMADHCQ9H3L0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMADHCQ9H3L0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms