Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAIP1Q9H074 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAIP1Q9H074 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAIP1Q9H074 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms