Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCOLN1Q9GZU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCOLN1Q9GZU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms