Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF3Q9GZM5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms