Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2J2Q9GZM3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms