Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SRCIN1Q9C0H9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRCIN1Q9C0H9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRCIN1Q9C0H9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRCIN1Q9C0H9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms