Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM5Q9C035 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM5Q9C035 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms