Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM7Q9C029 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms