Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXP3Q9BZS1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms