Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RNF17Q9BXT8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
RNF17Q9BXT8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RNF17Q9BXT8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms