Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3Q9BXJ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms