Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGR4Q9BXB1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR4Q9BXB1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms