Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAIPQ9BWF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAIPQ9BWF2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms