Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD3Q9BV44 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD3Q9BV44 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD3Q9BV44 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms