Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf16Q9BUW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms