Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB6Q9BUF5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB6Q9BUF5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms