Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC1Q9BTT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC1Q9BTT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC1Q9BTT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms