Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAGR1Q9BTK6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms