Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT11Q9BT88 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT11Q9BT88 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT11Q9BT88 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT11Q9BT88 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT11Q9BT88 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT11Q9BT88 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT11Q9BT88 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms