Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms