Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TM2D3Q9BRN9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms