Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDF4Q9BRK5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SDF4Q9BRK5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms