Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REEP2Q9BRK0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
REEP2Q9BRK0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms