Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS7

HEPH, Hephaestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEPHQ9BQS7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HEPHQ9BQS7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HEPHQ9BQS7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HEPHQ9BQS7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms