Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3GL1Q99961 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3GL1Q99961 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL1Q99961 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL1Q99961 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms