Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BARD1Q99728 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms