Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD9AQ99638 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD9AQ99638 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms