Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDNQ99608 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDNQ99608 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDNQ99608 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNQ99608 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNQ99608 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNQ99608 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNQ99608 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNQ99608 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNQ99608 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNQ99608 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNQ99608 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNQ99608 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNQ99608 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNQ99608 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNQ99608 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNQ99608 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNQ99608 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNQ99608 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNQ99608 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNQ99608 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNQ99608 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNQ99608 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNQ99608 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNQ99608 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNQ99608 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNQ99608 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNQ99608 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDNQ99608 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDNQ99608 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDNQ99608 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDNQ99608 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDNQ99608 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDNQ99608 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDNQ99608 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDNQ99608 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDNQ99608 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDNQ99608 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDNQ99608 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDNQ99608 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNQ99608 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNQ99608 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNQ99608 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNQ99608 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNQ99608 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNQ99608 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNQ99608 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNQ99608 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNQ99608 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNQ99608 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNQ99608 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNQ99608 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNQ99608 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNQ99608 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNQ99608 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNQ99608 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNQ99608 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDNQ99608 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDNQ99608 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDNQ99608 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDNQ99608 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDNQ99608 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDNQ99608 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDNQ99608 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDNQ99608 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDNQ99608 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDNQ99608 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDNQ99608 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDNQ99608 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDNQ99608 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDNQ99608 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDNQ99608 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDNQ99608 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDNQ99608 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDNQ99608 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDNQ99608 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms