Protein–RNA interactions for Protein: Q99519

NEU1, Sialidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU1Q99519 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEU1Q99519 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEU1Q99519 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms