Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMD1Q99460 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMD1Q99460 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMD1Q99460 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms