Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
IFT140Q96RY7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
IFT140Q96RY7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC40.22■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
IFT140Q96RY7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms