Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX1Q96RV3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PCNX1Q96RV3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PCNX1Q96RV3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PCNX1Q96RV3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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