Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF13CQ96RJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms