Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PANX1Q96RD7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PANX1Q96RD7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms