Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK1Q96QP1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms