Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMG1Q96Q15 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG1Q96Q15 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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