Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
SAMD11Q96NU1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAMD11Q96NU1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD11Q96NU1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms