Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFP42Q96MM3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZFP42Q96MM3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZFP42Q96MM3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP42Q96MM3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP42Q96MM3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP42Q96MM3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP42Q96MM3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP42Q96MM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP42Q96MM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms