Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC138Q96M89 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC138Q96M89 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms