Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPGRIP1Q96KN7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPGRIP1Q96KN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPGRIP1Q96KN7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms