Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM87BQ96K49 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87BQ96K49 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms