Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC22AQ96IW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms