Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGSM3Q96HU1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms